第四百零一章 目标RNA

第四百零一章 目标RNA (第2/2页)

得到这些数据后，庞学林开始通过MOSS控制的数学方法建立蛋白质以及非编码RNA的结构与动态特征的动力学以及生物功能模型，并且让MOSS编写蛋白质与非编码RNA的模拟软件。
　　
　　这项工作很繁琐，也非常复杂，但庞学林硬是凭借着自己强大的数学功底，以及量子计算机超强的计算能力完成软件的编写工作。
　　
　　当他将这款软件应用到实际工作中去的时候，瞬间就把斯普鲁斯他们镇住了。
　　
　　通过这款软件，科学家们可以主动构建一些全新的RNA分子以及蛋白质分子，然后通过软件模拟出这些分子的生物学功能。
　　
　　结果他们很快就发现，这款软件不但模拟精度极高，甚至还可以预言一些未曾发现的蛋白质分子以及RNA分子的存在。
　　
　　甚至于，庞学林利用这款软件，构建出了T病毒的生物动力学模型，完善了T病毒入侵人体的图景。
　　
　　首先，T病毒通过其表面糖蛋白与宿主细胞的特异性受体结合，接着病毒囊膜与细胞浆膜（即通过不依赖于PH途径）或有酸性环境的核内体膜（PH依赖途径）融合后释放病毒核糖核蛋白复合体（RNP）至细胞浆，在转录过程中每一mRNA得以合成，而通过复制产生全长反义基因组RNA，使其作为病毒基因组RNA的模板。
　　
　　新合成的RNP复合体与病毒结构蛋白在细胞浆膜或高尔基体膜组装，然后释放新合成的子代病毒。
　　
　　子代病毒在细胞内生长繁殖，然后对周边的细胞发起大规模进攻。
　　
　　而且，T病毒还有一个神奇的特性，它体内的RNA不仅能够利用人体正常细胞进行繁殖，甚至还可以与人体内的一些非编码RNA形成联动效应，大规模改变人体细胞的生长代谢速度。
　　
　　而庞学林他们要做的，就是寻找一种能够对T病毒的RNA形成干扰的非编码RNA，从而使得T病毒陷入沉寂状态，即使感染人体，也因为基因没办法表达，从而无法在人体内大范围繁殖。
　　
　　……
　　
　　时间一天天流逝，不知不觉间，半年的时间转瞬即逝。
　　
　　这天，庞学林刚来到实验室，负责值班的斯普鲁斯兴冲冲地找到了庞学林，大笑道：“庞教授，我们找到可以使得目标RNA了？”
　　
　　“找到了，是第几组？”
　　
　　庞学林眼睛一亮，有些惊喜道。
　　
　　之前利用庞学林开发的那款蛋白质及RNA分子生物动力学功能模拟软件，庞学林他们编写出了一种具备使得T病毒基因陷入沉默状态的特殊RNA。
　　
　　随后，他们通过对人体细胞内成千上万种RNA筛选，从中找出了两百多种RNA。
　　
　　接下来，就是一组一组地实验过去。
　　
　　这种工作很繁琐，基本上就是不停地重复之前的工作。
　　
　　庞学林倒没有主动参与进去，他已经规划好了后续的研究路线，只等着找到目标RNA的那一天。
　　
　　只是这段时间，实验室已经试验了上百种非编码RNA，始终没能达到想要的效果。
　　
　　庞学林都怀疑自己之前的路是不是走错了，如果一年的约定时间到了，艾丽丝真要离开肯普滕镇，走上与保护伞公司直接对抗的道路，那庞学林真没太好的办法去阻止对方。
　　
　　斯普鲁斯道：“是第112组，我们将这种RNA活性提取物注射到细胞内后，通过动态APT观察到细胞内的T病毒含量大幅度降低，甚至已经停止了RNP复合体的合成。”
　　
　　庞学林点了点头，微笑道：“这是个好消息，有观察到112号非编码RNA如何实现对T病毒RNA造成基因沉默的机制吗？”
　　
　　斯普鲁斯道：“我们发现，112号RNA进入细胞后，通过细胞内的RNA-蛋白质联动，可以使得组蛋白N端结构域的赖氨酸残基实现去乙酰基化加工和甲基化修饰，这一过程由甲基转移酶催化，修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰，T病毒RNA可以与经过甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质形成异染色质，在上述过程中，除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外，有时也需要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰，这种修饰的最终结果就是T病毒相应区段的基因沉寂失去转录活性……”
　　
　　庞学林沉吟片刻，说道：“把阿什福德博士、黄瑜教授、柏克莱教授他们都找来，我们召开一个闭门会议，研究一下后续的工作计划。”
　　
　　“好！”
　　
　　斯普鲁斯点头道。
　　
　　找到目标RNA只是一个起点，接下来还有更重要的工作要做。
　　
　　庞学林想要的可不止是让人类对T病毒免疫而已，他想要做的，如何利用这种目标RNA制造一种空气传播的新型病毒，这种新型病毒在人体体内基本上相当于一种无害的内源性逆转录病毒，但是在丧尸体内以及T病毒的感染者体内，却可以瞬间让他们体内的T病毒失活。
　　
　　这样的话，到时候对付斯宾塞以及他的手下的时候，失去了T病毒赋予的各种超能力，那么斯宾塞他们在庞学林面前也不过是一群土鸡瓦狗而已。
　　
　　这种工作，就需要阿什福德、柏克莱、黄瑜他们群策群力了。
　　
　　果然，在得知找到目标RNA后，阿什福德、柏克莱他们脸上均露出了欣喜之色。
　　
　　目标RNA的发现，让他们在这个黑暗的时代，看到了一缕希望的曙光。
　　
　　不过利用目标RNA组装新病毒同样不是一件简单的事，庞学林和斯普鲁斯、阿什福德、柏克莱还有黄瑜讨论了整整一周的时间，才完成了目标病毒的设定。
　　
　　接下来，他们便通过将这种RNA与腺病毒（AAV，前文提到过，这种病毒对人体无害，很多人体内都有，科学家们经常利用腺病毒来制造疫苗）相结合，然后利用新型的基因编辑工具，在腺病毒内添加了部分基因，使得这种新型病毒具备空气传播能力。
　　
　　而到了这个时候，距离庞学林和艾丽丝的约定，只剩下不到一个月的时间了。
　　
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